Genotypic characterization of the IL-12b allele and Idd4 intervals in recombinant congenic murine strains
| Straina . | IL-12p40 Alleleb . | . | IL-12p40 Expression Defect . | Idd4 Locusc . | . | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| . | 506 nt . | 880 nt . | . | Interval (cM) . | Markers . | ||
| C57BL/6 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd1 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd1/3/10 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd4 | C | C | + | 20–72 | D11Mit20− | ||
| D11mit42 | |||||||
| B6.NOD.Idd1/Idd4 | C | C | + | 20–72 | D11Mit20− | ||
| D11mit42 | |||||||
| B6.NOD.Idd1/Idd5 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd1/Idd6 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd13 | T | T | − | None | None | ||
| CBA | T | T | − | None | None | ||
| CBc.NO7C | T | T | − | 40–48 | D11Acrb− | ||
| D11Mit36 | |||||||
| CBc.NO6 | T | T | − | 40–70 | D11Acrb− | ||
| D11Mit214 | |||||||
| NOcCB-1 | C | C | + | 17–40 | D11Mit84− | ||
| D11Acrb | |||||||
| NOD | C | C | + | n.a. | n.a. | ||
| DBA/2 | Cd | Cd | −d | n.a. | n.a. | ||
| Straina . | IL-12p40 Alleleb . | . | IL-12p40 Expression Defect . | Idd4 Locusc . | . | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| . | 506 nt . | 880 nt . | . | Interval (cM) . | Markers . | ||
| C57BL/6 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd1 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd1/3/10 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd4 | C | C | + | 20–72 | D11Mit20− | ||
| D11mit42 | |||||||
| B6.NOD.Idd1/Idd4 | C | C | + | 20–72 | D11Mit20− | ||
| D11mit42 | |||||||
| B6.NOD.Idd1/Idd5 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd1/Idd6 | T | T | − | None | None | ||
| B6.NOD.Idd13 | T | T | − | None | None | ||
| CBA | T | T | − | None | None | ||
| CBc.NO7C | T | T | − | 40–48 | D11Acrb− | ||
| D11Mit36 | |||||||
| CBc.NO6 | T | T | − | 40–70 | D11Acrb− | ||
| D11Mit214 | |||||||
| NOcCB-1 | C | C | + | 17–40 | D11Mit84− | ||
| D11Acrb | |||||||
| NOD | C | C | + | n.a. | n.a. | ||
| DBA/2 | Cd | Cd | −d | n.a. | n.a. | ||
Recombinant congenic strains with Idd4 loci on a C57BL/6 background (13 ) or with roughly 50% CBA and 50% NOD genomes with different combinations of Idd loci (12 ).
Polymorphism in the IL-12p40 allele that distinguishes the NOD from the C57BL/6 and CBA alleles (14 ).
Idd4 intervals on murine chromosome 11 defined by different microsatellite markers (12 13 ).
Refs. 6 and 14 .