Exon-intron splice-junction sequences of the hTdT gene
| Exon . | Position in Open Reading Frame . | Size of Exon (bp) . | Sequence of Exon-Intron Junctionsa . |
|---|---|---|---|
| . | . | . | 5′-splice donor… . . intron… . . 3′-splice acceptor . |
| I | 1–203 | 203 | GCTCAG gtaggacagc… … … … … . . cattttgcag TGATTC |
| II | 204–378 | 175 | CTTGTT gtaagtgtca… … … … … . . atttgtttag GTGAGA |
| III | 379–507 | 129 | TTCACG gtaacgggac… … … … … . . tatcctgcag GATGCC |
| IV | 508–678 | 171 | ATAGAG gtaagggtga… … … … … . . tgtccattag GAGATT |
| V | 679–750 | 72 | TTCAAA gtaagtgatt… … … … … . . tccattttag CTCTTT |
| VI | 751–874 | 124 | AAGCAG gtaaattgtc… … … … … . . cagaaagcag GTAAAT |
| VII | 875–925 | 51 | GTCGTG gtggagctct… … … … … . . ggcctctcag GATTTC |
| VIII | 926–1058 | 133 | CCGGAG gtaaataact… … … … … . . tgaaaattag GGGTAA |
| IX | 1059–1164 | 106 | AAGAAG gtgagaagaa… … … … … . . ttcttttcag GGATTA |
| X | 1165–1410 | 246 | TCCCGG gtaagtgcta… … … … … . . tcctatccag CAGTTT |
| XI | 1411–1494 | 84 | ACCAAG gtacagttct… … … … … . . aatatctgaa TGCACA |
| XII | 1495–1521 | 27 | TTTCAG aggatattcc… … … … … . . atgttttcag AGGATA |
| XIII | 1522–1608 | 87 | GCCTAG gaaagtgttg |
| Exon . | Position in Open Reading Frame . | Size of Exon (bp) . | Sequence of Exon-Intron Junctionsa . |
|---|---|---|---|
| . | . | . | 5′-splice donor… . . intron… . . 3′-splice acceptor . |
| I | 1–203 | 203 | GCTCAG gtaggacagc… … … … … . . cattttgcag TGATTC |
| II | 204–378 | 175 | CTTGTT gtaagtgtca… … … … … . . atttgtttag GTGAGA |
| III | 379–507 | 129 | TTCACG gtaacgggac… … … … … . . tatcctgcag GATGCC |
| IV | 508–678 | 171 | ATAGAG gtaagggtga… … … … … . . tgtccattag GAGATT |
| V | 679–750 | 72 | TTCAAA gtaagtgatt… … … … … . . tccattttag CTCTTT |
| VI | 751–874 | 124 | AAGCAG gtaaattgtc… … … … … . . cagaaagcag GTAAAT |
| VII | 875–925 | 51 | GTCGTG gtggagctct… … … … … . . ggcctctcag GATTTC |
| VIII | 926–1058 | 133 | CCGGAG gtaaataact… … … … … . . tgaaaattag GGGTAA |
| IX | 1059–1164 | 106 | AAGAAG gtgagaagaa… … … … … . . ttcttttcag GGATTA |
| X | 1165–1410 | 246 | TCCCGG gtaagtgcta… … … … … . . tcctatccag CAGTTT |
| XI | 1411–1494 | 84 | ACCAAG gtacagttct… … … … … . . aatatctgaa TGCACA |
| XII | 1495–1521 | 27 | TTTCAG aggatattcc… … … … … . . atgttttcag AGGATA |
| XIII | 1522–1608 | 87 | GCCTAG gaaagtgttg |
Uppercase letters denote exon sequence, and lowercase letters denote intron sequence. Newly identified exons are in bold. Putative cryptic donor and acceptor sites are in italics. Nearly invariant dinucleotides gt and ag flanking either end of the intron sequence are underlined.